染色体的三维结构指的是染色体在空间中的组织方式和构象,它对于基因表达调控和细胞功能至关重要。染色体通常被认为是一条线性的 DNA 分子,但在细胞核中,它们呈现出复杂的折叠和组织形式,形成了一种高度有序的三维结构。
染色体的三维结构对细胞内基因表达的调控起着关键作用。通过调控染色体上不同区域之间的距离和相互作用,细胞可以精确地控制基因的转录和沉默。此外,染色体的三维结构还影响 DNA 复制、修复和重组等重要的细胞过程。
染色体的三维结构对于理解基因组的功能和调控至关重要。通过技术如染色体构象捕获和单细胞染色体构象分析,科学家们能够揭示染色体在空间中的组织方式,以及基因之间的相互作用。这有助于我们更深入地了解基因表达调控、染色体异常和疾病发生的机制。
Arima Hi-C 是一种高通量测序技术,用于研究染色体的三维结构。其原理基于染色体构象捕获(chromosome conformation capture,3C)技术的扩展。其核心是邻近连接,即通过交联核 DNA、用限制性酶消化、生物素标记,并在使用标准 NGS 方法进行测序之前进行邻近连接。这使您可以在一次检测中捕获关键的三维基因组组织和长距离遗传信息。
1. Cross-linking(交联):首先,细胞中的染色体被交联,使得距离较近的染色体区域之间形成交联。这可以通过使用染色体交联剂(cross-linking agent)如福尔马林来实现。
2. Digestion(消化):然后,染色体被酶消化,将交联的染色体切割成小片段。这样做可以保留交联的区域,同时消除其余的连接。
3. DNA端连接(Ligation):接下来,利用连接酶(ligase)将距离较近的交联片段的DNA末端连接起来,形成一个连接的染色体分子。
4. 逆交联(De-crosslinking):之后,通过逆转交联,将交联的染色体分子恢复为单个DNA链。
5. 测序(Sequencing):最后,对连接的DNA进行高通量测序,得到染色体上各个区域之间的相互作用频率。
Arima Genomics 的 Hi-C 产品具有以下特点:
1. 高质量的测序数据:Arima Genomics 的 Hi-C 产品提供高质量的测序数据,能够捕获染色体间和染色体内的相互作用,从而提供详细的染色体三维结构信息。
2. 全基因组覆盖:其产品覆盖全基因组范围,能够对染色体上的各个区域之间的相互作用进行全面的分析。
3. 优化的实验流程:Arima Genomics 提供了优化的实验流程和试剂盒,简化了 Hi-C 实验的操作步骤,提高了实验效率和可重复性。
4. 专业的生物信息学分析支持:除了提供实验试剂盒,Arima Genomics 还提供了专业的生物信息学分析支持,帮助研究人员对 Hi-C 数据进行分析和解释。
Arima Genomics 成立于2015年,专注于开发高通量测序技术以及生物信息学分析工具,其 Hi-C 产品在染色体三维结构研究领域备受关注。Arima的目标是通过3D基因组的力量推进生命科学,促进对基因组顺序和结构及其对人类健康、疾病、物种演化作用的理解。