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Part8—Denovo FCS Express 6 细胞周期的流式数据分析

作者:admin信息来源:达科为日期:2018年01月31日打印字体:  
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Denovo的微信推文已经陪伴大家走过了7期的内容,想必大家已经被Denovo强大的流式数据分析功能彻底圈粉了吧!前面7期的内容主要介绍了Denovo软件的安装,流式数据分析的入门篇,流式数据的批量处理,多色分析及流式凋亡数据分析。那么本期内容更厉害了呢!在本期内容中小达君将给大家奉上细胞周期的流式数据分析的相关内容。赶快打开电脑,搬好小板凳,和小达君一起开始实战演习吧~

♣ 演示工具:装有Denovo FCS Express 6的电脑一台(参考入门篇的试用装版本安装~)

♧ 演示数据:细胞周期的流式数据分析

♣ 演示内容:细胞周期数据的分析,关于细胞周期各个参数的调用,统计学图表的建立

1.添加实验数据


参考前面推文可知,在Denovo软件中添加数据的方式有多种,以下通过Data list命令按钮直接添加,具体操作如下: 



2.数据分析


将数据添加进来之后,圈门,把目的细胞拖拽出来,单独分析,首先需要去除粘连细胞,不同的流式细胞仪排除粘连细胞时,用到的参数有时候不一样,此处,通过改变PI通道的参数(分别改成FL2-A及FL2-W)来去除粘连细胞,具体操作如下图:



3.细胞周期的流式数据分析模板建立


a.粘连细胞去除之后,可直接调用Denovo自带的细胞周期分析模板,完成数据分析,具体操作如下:



b.将细胞周期分析的模板调出来之后,点击OK,会弹出如下图所示的界面,然后可以利用insert按钮,插入文本框,从而可实现图注的编辑,如下图所示(我们可以对图中的每个峰进行命名,从而可以对细胞周期中的各个时期进行命名和解释):



4.细胞周期的流式数据分析中相关参数的调用


a.在细胞周期分析的模板中,有不同的模板可以调用,用户可以根据自己的需要,选择相应的细胞周期数据分析模型,具体操作如下图所示:



b.不同的细胞周期数据分析模型,其分析标准不一样,Denovo对不同的模型均作了相关的定义,用户可以直接查看,具体操作如下:



c.当完成细胞周期数据分析后,接上面一步,可以通过Statistics按钮,将相关的参数调出来,具体展示如下:



5.利用Spreadsheets插入图表


(参考Part7的微信推文,里面有详细的关于Spreadsheets的使用)

a.举例,对细胞周期中G1期,S期及G2期各细胞比列的情况分析并做成柱形图及饼状图,直接插入Spreadsheets,然后将相应的数据拖拽入表格中,点击insert命令按钮,插入相应的柱形图和饼状图,操作如下:



b.同时通过Format按钮可以更改图形的相关参数,可以使图表的排版及色彩布置达到令用户满意的效果,如下图所示:(具体操作可参见part7-凋亡数据分析的中关于插入图表的介绍)



由于微信的演示空间有限,本期的内容介绍就到此结束,Denovo FCS Express 6还有更多,更好,更强的流式数据分析功能,我们期待和您共同探讨,感兴趣的可以在下方留言并留下您的联系方式,我们技术部的同事会和您联系~


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